جهان‌های Svart Alfheim و Accelerated World در حال ترکیب با یکدیگر هستند. در میان این هرج و مرج‌، شخصیت Yui گم شده و Kirito برای پیدا کردن او باید 7 پادشاه خالص دنیای Accelerated World را به چالش بکشد. بازیکنان از هر دو گروه در جنگ دنیا‌ها گرد هم آمده، جایی که در آن قویترین اعضای دو گروه Burst Linkers و ALO ماموریت دارند تا Yui را از دست Personna Babel نجات دهند. دنیاها با یکدیگر درگیر می‌شوند، در حالی که شخصیت‌های دو سری موفق آقای رکی کاواهارا (Reki Kawahara)، در داستانی کاملا جدید کنار یکدیگر جمع شده تا با سفر در زمان شخصیت Yui را نجات دهند. با ترکیب قدرت‌ها، گروه سه نفره خود را از میان شخصیت‌های محبوبتان از دو دنیای Accel World (سرعت/تکنیک‌های مخصوص) و Sword Art Online (پرواز/جادو) انتخاب کنید.