مجموعه Naruto Shippuden: Ultimate Ninja Storm Trilogy شامل بازی Naruto: Ultimate Ninja Storm،‌ بازی Naruto Shippuden: Ultimate Ninja Storm 2 و بازی Naruto Shippuden: Ultimate Ninja Storm 3 در کنار تقریبا تمام محتوای دانلودی از جمله شخصیت‌ها، لباس‌ها و اپیزودها می‌شود. با توجه به گفته‌ی بندای نامکو بازیکنان سه‌گانه هیچ ارتباطی با دارندگان نسخه‌های پیشین سری اولتیمیت نینجا استورم ندارند. علاوه بر این برای نخستین بار اولین شماره‌ی Naruto: Ultimate Ninja Storm با پشتیبانی از سیستم تروفی منتشر می‌‌شود. علاوه بر این، Ultimate Ninja Storm از اسلات ذخیره‌سازی پشتیبانی نمی‌کند. در بازی Naruto Shippuden: Ultimate Ninja Storm 2 نیز شاهد تغییر برخی از تروفی‌ها هستیم. با توجه به درخواست‌ها در شماره‌ دوم، Ultimate Adventure شامل چالش‌های Jum-BANG! یک تا چهار نمی‌شود. کالکشن کاغذهای رنگی نیز شامل دومین نسخه اولتیمیت نینجا استورم مجموعه سه‌گانه نمی‌شود. بیشترین تغییرات اما در رابطه با ویژگی‌های Naruto Shippuden: Ultimate Ninja Storm 3 اعمال شده است. در کنار تغییر برخی تروفی‌ها و روش دسترسی به آنها، این نسخه دیگر از ویژگی سه‌بعدی استریوسکوپیک پشتیبانی نمی‌کند. لباس هوکاگه ناروتو اکنون از ابتدا آزاد است و سومین نسخه در پلی‌استیشن 4 از ویژگی خارج کردن پاداش‌های دانلودی درون بازی برای استفاده در تم‌های سفارشی پشتیبانی نمی‌کند. تصاویر ماموریت‌های چالشی و همچنین بخش داستانی Uchiha Brothers vs. Kabuto (Sage Mode در دسترس است. برای تماشای تصاویر باید به بخش Ultimate Adventure، منو و سپس Shinobi World Chronology یا همان گاه‌نگار جهان شینوبی مراجعه کنید.